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Das liegt ggf. am Connection-Pooling.
Solange dein Java-Programm noch aktiv ist, wird ein Close der Verbindung nicht durchgeführt sondern diese in den Pool gestellt.
Da die AS/400 Dateien ggf. offen hält (ODP's), bleibt die Datei eben im Zugriff (Shared-Sperre).
Wenn du die Sperre explizit freigeben willst, musst du die Verbindung so schließen, dass diese nicht in den Pool zurückgeht. Ggf. ist das Pooling (mit leichten Performance-Nachteilen) auszuschließen.
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Könnte es sein, das du versucht auf einer VIEW ein update zu machen?
Auf einer VIEW geht kein update.
Ich würde dir auch raten, die close statements in den catch-Block mit einzubauen.
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