Soweit sieht eigentlich alles normal aus.
Allerdings ist meine Vermutung des temporären Index nicht ganz falsch.

Die nachricht "Empfohlener Zugriffspfad für Datei QADBXREF." sollte man mal mit F1 im Detail ansehen.
Es sieht mir ganz danach aus, dass Query nicht steht, sondern die AS/400 ganz einfach für die Schemaabfrage so lange benötigt.

Das kann auch an einem fehlerhaften SQLPKG QGPL/QZDAPKG liegen.

Bereinigung:
ENDHOSTSVR *DATABASE
DLTSQLPKG QGPL/QZDAPKG
STRHOSTSVR *DATABASE

Das SQLPKG wird automatisch neu erstellt.