Ich hatte man das gleiche Syntom:
Bei mir war das Problem, dass der ENDWEBQRY nicht alle Jobs beendet hat.

1.)
Es laufen ja nicht nur die Webjobs (im QHTTPSVR) sondern auch der Datenserver (EDAxxxx + TSCLIENT) im QSYSWRK. Geh sicher, dass alle Jobs beendet sind.

Ich dachte bei mir zuerst an einen Portkonflikt und habe bei NETSTAT/3 gesehen, dass die 1133x Ports noch von einer alten Instanz gesperrt waren.

2.) Bei Problemen ist ein
STRWEBQRY mit
OPTION *BOTH

auch nie verkehrt.

3.) Ich nehme an die Gruppenprofile sind noch drinnen bzw. auch der QWEBQRYADM kann sich nicht anmelden?

4.) In manchen Fällen kann die Console auch Auskunft geben...
http://deineAS400:11331/webquery_html/wfconsole.hm

/Robert