Da gibts leider kein direktes Werkzeug.
Ich stelle mir das nur so vor:
Ausgabe der MSGF's in einen Spool.
CPYSPLF in eine PF, mittels SQL die MSGID's und Texte extrahieren und mit der 2. Ausgabe abgleichen.

Ansonsten gibts da nur das MRGMSGF mit der man schnell fehlende MSGID's einmischen kann.