Eine richtige Versionsverwaltung (SVN, GIT, Mercurial ...) kommt nicht in Frage?
Ist zwar eine Umstellung, aber es lohnt sich.
Die ganzen Probleme die die alte "Versionierung" mit sich brachte (überschreiben, gelöscht, vergessen zu sichern ...) sind dadurch mit einem Wisch weg.

lg Andreas