Nun, da wende dich einfach am besten an Birgitta.
Denn ich habe da noch keine hierarchischen XML's erstellen können sondern nur flache.

Für Java ist kein Websphere erforderlich.
Ich entwickle Java ganz normal mit Eclipse, binde die AS/400-Java-Toolbox für JDBC u.a. ein.
Wenn ich fertig bin und auch getestet habe, schiebe ich die .jar ins IFS und starte das per JAVA-Kommando.