Bei Java gibts den, nach meinem Wissen, nur im Spaicher.
Bei Net wird der im Microsoft Assembly Cache gespeichert (in den Tiefen von Windows).
Wenn du bei neuen Versionen die Versionsnummer nicht erhöhst, könnten u.U. alte Versionen aufgerufen werden. Ich glaube aber, dass für den Cache das Erstelldatum dazu genommen wird.