Hallo Olli,
hast Du schon einmal aufgrund der Fehlermeldungen
überprüft, ob die Klasse vorhanden ist:

Überprüfen Sie die Datei MIFunctions.class:
/qibm/proddata/os400/java400/com/ibm/as400/jvm
Wenn es den java400-Ordner nicht gibt, installieren Sie bitte 5722SS1, Option 3 erneut.

Thema Berechtigungen:

das Root Verzeichnis sollte *RX haben und
das Verzeichnis:
Hier sollte grundsätzlich jeder zu berechtigt sein:
QIBM/ProdData/OS400/Java400/com/ibm/as400/jvm/MIFunctions.class