Tja, da ist wohl Handarbeit gefragt.

Es gibt da nur ein Tool, dass die verwendeten Dateien eines Queries auslesen kann, aber eine Änderung ist leider nicht möglich.
Vielleicht kann man dann ja ggf. OVRDBF's machen, was aber trotzdem Handarbeit bedeutet, da ja die meisten Queries aus WRKQRY aufgerufen werden.