Das ist eigentlich überhaupt kein Problem.
Du musst halt nur sicherstellen, dass ggf. die gleiche Teildatei nicht mehrfach verarbeitet wird.
Der ALCOBJ erlaubt auch die Sperre einer Teildatei, es muss also nicht die gesamte Datei gesperrt werden. Vielleicht hilft dir das ja schon.

Übrigens:
Der CPYF macht ja auch nichts anderes, als die Daten zu lesen, wie jedes andere Programm auch. Und da greifen ja auch hunderte Job's gleichzeitig zu.