Das hängt von der OS/400 Version (Netserver-Version), der Linux-Kernel und der Linux Samba (Client) Version ab.

V5R1/2/3- kernel version of 2.4.4 or greater and Samba 2.0.7 or greater
V5R4 - kernel version of 2.4.4 or greater and Samba 3.0.9 or greater

Weitere Info's, hier:
IBM eServer iSeries - iSeries NetServer: Support for Linux